日常經(jīng)濟業(yè)務(wù)中，常用的經(jīng)濟組織形式除了有限責(zé)任公司，還包括個人獨資企業(yè)和有限合伙企業(yè)。個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)不征收企業(yè)所得稅，只為個人投資人就取得的經(jīng)營所得比照個體工商戶征收個人所得稅。根據(jù)新個稅法的要求，納稅人取得經(jīng)營所得，以每一納稅年度的收入總額減除成本、費用及損失后的余額為應(yīng)納稅所得額，按5%-35%的五級超額累進稅率表計算個人所得稅，并預(yù)繳稅款;并在取得所得次年3月31日前辦理匯算清繳。
一、個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者的工資不得在稅前扣除，即出資人的工資應(yīng)當(dāng)并入經(jīng)營所得計算繳納個人所得稅。但對出資人取得經(jīng)營所得，沒有綜合所得的，計算其每一納稅年度的應(yīng)納稅所得額時，應(yīng)當(dāng)減除費用6萬元、專項扣除、專項附加扣除以及依法確定的其他扣除。專項附加扣除在辦理匯算清繳時減除。納稅人同時取得綜合所得和經(jīng)營所得的，不能同時在經(jīng)營所得和綜合所得中分別減除費用6萬元。有綜合所得的，在綜合所得中減除;沒有綜合所得的，在經(jīng)營所得中減除。
二、投資者及其家庭發(fā)生的生活費用不允許在稅前扣除。個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者及其家庭發(fā)生的生活費用與企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營費用混合在一起，并且難以劃分的，全部視為投資者個人及其家庭發(fā)生的生活費用，不允許在稅前扣除。
三、個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)對外投資分回的利息或者股息、紅利，不并入企業(yè)的收入，而應(yīng)單獨作為投資者個人取得的利息、股息、紅利所得，按“利息、股息、紅利所得”應(yīng)稅項目計算繳納個人所得稅。但如果合伙企業(yè)是符合《創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)管理暫行辦法》(發(fā)展改革委等10部門令第39號)或者《私募投資基金監(jiān)督管理暫行辦法》(證監(jiān)會令第105號)的有關(guān)規(guī)定，并按照上述規(guī)定完成備案且規(guī)范運作的合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)(基金)，則根據(jù)財政部、稅務(wù)總局、發(fā)展改革委、證監(jiān)會《關(guān)于創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)個人合伙人所得稅政策問題的通知》(財稅〔2019〕8號)的規(guī)定，創(chuàng)投企業(yè)可以選擇按年度所得整體核算，也可選擇單一核算方式。但其個人合伙人從創(chuàng)投企業(yè)取得的對外投資分回的利息或者股息、紅利，仍應(yīng)按照國稅函〔2001〕84號文件規(guī)定，單獨作為投資者個人取得的利息、股息、紅利所得，按“利息、股息、紅利所得”應(yīng)稅項目計算繳納個人所得稅。
四、合伙企業(yè)的合伙人以合伙企業(yè)的生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得，按照合伙協(xié)議約定的分配比例確定應(yīng)納稅所得額。生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得，包括合伙企業(yè)分配給所有合伙人的所得和企業(yè)當(dāng)年留存的所得(利潤)。也就是說，個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)的“生產(chǎn)經(jīng)營所得”已經(jīng)就是投資者個人的所得，繳納過個人所得稅后，也就是稅后凈所得，不存在分紅的個人所得稅問題。
五、合伙企業(yè)的合伙人按照下列原則確定應(yīng)納稅所得額：(1)合伙企業(yè)的合伙人以合伙企業(yè)的生產(chǎn)經(jīng)營所得和其得，按照合伙協(xié)議約定的分配比例確定應(yīng)納稅所得額。合伙協(xié)議不得約定將全部利潤分配給部分合伙人。(2)合伙協(xié)議未約定或者約定不明確的，以全部生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得，按照合伙人協(xié)商決定的分配比例確定應(yīng)納稅所得額。(3)協(xié)商不成的，以全部生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得，按照合伙人實繳出資比例確定應(yīng)納稅所得額。(4)無法確定出資比例的，以全部生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得，按照合伙人數(shù)量平均計算每個合伙人的應(yīng)納稅所得額。
六、自2022年1月1日起，持有股權(quán)、股票、合伙企業(yè)財產(chǎn)份額等權(quán)益性投資的個人獨資企業(yè)、合伙企業(yè)(以下簡稱獨資合伙企業(yè))，一律適用查賬征收方式計征個人所得稅。在實際操作中，口徑不一。以上海為例，進入2021年新辦獨資合伙企業(yè)一律不允許核定征收。
七、個人投資兩個或兩個以上獨資、合伙企業(yè)的，投資者個人應(yīng)分別向企業(yè)實際經(jīng)營管理所在地稅務(wù)部門預(yù)繳個人所得稅，年度終了后辦理匯算清繳。主要有兩種情況：
一是投資者興辦的企業(yè)全部是個人獨資企業(yè)的，分別向各企業(yè)實際經(jīng)營管理所在地稅務(wù)部門辦理年度納稅申報，并依其投資的全部個人獨資企業(yè)的經(jīng)營所得確定適用稅率，以本企業(yè)實際生產(chǎn)經(jīng)營所得為基礎(chǔ)，計算應(yīng)繳稅款，辦理匯算清繳。計算公式為：應(yīng)納個人所得稅稅額=應(yīng)納稅所得額×適用稅率-速算扣除數(shù)，應(yīng)納稅所得額=各個獨資企業(yè)應(yīng)納稅所得額的合計數(shù)。本企業(yè)投資者應(yīng)納稅額=應(yīng)納個人所得稅稅額×本企業(yè)應(yīng)納稅所得額÷各個獨資企業(yè)應(yīng)納稅所得額的合計數(shù)，本企業(yè)投資者應(yīng)補繳的個人所得稅稅額=本企業(yè)投資者應(yīng)納個人所得稅稅額-本企業(yè)投資者預(yù)繳個人所得稅稅額
二是投資者興辦企業(yè)中有合伙企業(yè)的，將投資者在合伙企業(yè)中應(yīng)分配的應(yīng)納稅所得額與其投資于獨資企業(yè)的應(yīng)納稅所得額合并，確定應(yīng)納個人所得稅稅額。投資者應(yīng)向經(jīng)常居住地稅務(wù)部門申報納稅，辦理匯算清繳;對于經(jīng)常居住地與其興辦企業(yè)的經(jīng)營管理所在地不一致的，應(yīng)選定其參與興辦的某一合伙企業(yè)經(jīng)營管理所在地辦理匯算清繳，并且在5年內(nèi)不得變更。
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